원천세 신고서에 총지급액만 넣고 세액을 빠뜨렸을 때 수정 순서

먼저 답부터 볼게요

총지급액이 맞아도 징수세액 누락은 별도로 바로잡아야 합니다

원천징수이행상황신고서는 인원·총지급액과 함께 징수세액, 가산세, 조정환급세액과 납부세액을 구분해 적습니다. 총지급액만 맞고 징수세액을 0원으로 신고했다면 실제 원천징수세액 발생 여부를 확인한 뒤 해당 신고서를 수정해야 할 수 있습니다.

수정 전에는 단순 입력 누락인지, 간이세액표상 세액이 실제 0원인지, 직원에게는 공제했지만 신고만 빠졌는지, 직원 급여에서도 공제하지 않았는지를 나눕니다. 이 구분에 따라 세무 신고뿐 아니라 급여명세서와 직원 정산도 달라집니다.

필요한 자료

당시 신고와 급여 계산의 원본을 함께 보세요

현재 급여프로그램 값만 보면 신고 당시 입력값과 달라질 수 있습니다.

• 당초 원천징수이행상황신고서와 접수증
• 해당 월 급여대장·급여명세서·이체내역
• 근로소득 원천징수부와 적용한 간이세액표
• 국세·지방소득세 납부내역과 지급명세서

AI로 생성된 이미지

처리 순서

누락 위치를 찾고 세금별로 수정 결과를 확인하세요

첫째, 소득자별 원천징수부를 다시 계산해 정상 징수세액을 확정합니다. 둘째, 당초 신고서의 귀속연월·지급연월과 소득구분 코드를 유지한 채 총지급액, 징수세액과 납부세액 중 잘못된 칸을 표시합니다.

셋째, 홈택스 수정신고 접수 결과를 확인하고 부족세액 및 원천징수 등 납부지연가산세를 납부합니다. 넷째, 위택스 등 지방소득세 특별징수와 지급명세서·간이지급명세서 금액을 대조해 별도 수정 대상이 있는지 확인합니다.

판단 기준

신고 누락과 급여 공제 누락을 분리하세요

직원 급여에서 세액은 정상 공제했지만 신고서에만 빠졌다면 회사 장부의 예수금 잔액과 미납세액을 맞추는 것이 핵심입니다. 신고도 공제도 빠졌다면 회사가 원천징수의무자로서 부족세액을 납부한 뒤 직원에게서 어떻게 정산할지 별도로 검토해야 합니다.

원천징수 세액은 법정기한까지 납부하지 않거나 과소납부하면 납부지연가산세 대상이 될 수 있습니다. 수정신고 화면의 계산값만 믿지 말고 접수증, 납부서와 실제 수납내역을 확인합니다.

실무 예시

총지급액 500만원, 징수세액 18만원이 빠졌다면

급여대장상 총지급액 500만원과 정상 근로소득세 18만원이 확인되는데 신고서는 총지급액 500만원, 징수세액 0원으로 접수됐다고 가정합니다. 원 신고의 귀속·지급연월과 소득구분을 확인해 징수세액과 납부세액을 반영한 수정신고를 검토합니다.

직원 급여에서 18만원을 이미 공제했다면 예수금과 실제 납부액을 연결합니다. 직원에게도 공제하지 않았다면 회사가 납부할 세액과 직원 정산은 같은 문제로 보지 말고, 급여 공제 근거와 안내 절차를 별도로 확인합니다.

주의할 점

원천세 수정이 지급명세서까지 자동으로 고치는 것은 아닙니다

원천징수이행상황신고서와 지급명세서·간이지급명세서는 제출 목적과 화면이 다릅니다. 총지급액이나 소득구분까지 잘못됐다면 각 자료의 수정 여부와 접수 결과를 따로 확인합니다. 지방소득세 특별징수도 국세 수정 결과가 자동 반영되는지 관할 지자체 시스템에서 확인합니다.

이 글은 2026년 10월 23일 현재 일반적인 원천세 오류 점검 순서입니다. 소득 종류, 반기납부 여부, 납부기한과 직원에게 실제 공제한 금액에 따라 처리와 가산세가 달라질 수 있으므로 홈택스 접수 결과와 관할 세무서 안내를 우선하세요.

공식 자료

최신 신고서 서식과 원천세 가산세 안내를 확인하세요

2026년 7월 게시된 원천징수이행상황신고서 서식은 총지급액·징수세액·납부세액을 구분합니다. 국세청은 과소납부 원천세의 납부지연가산세를 별도로 안내합니다.

공개 카페 검색결과는 반복 질문의 수요 확인에만 사용했으며 사례와 문장은 공식 기준에 맞춰 새로 구성했습니다.